不是。FlowJo是一款流式细胞术数据分析软件,功能强大,可以帮助用户分析细胞凋亡等实验结果,但这并不是唯一的选择。有很多其他的软件也可以用来分析来自流式细胞仪的凋亡图片或数据。这些软件包括:BDFACSDiva、FCSExpress和Cytobank等。因此流式凋亡的图片不是必须用flowj处理。
结果是不可以一起分析的,一般来说,细胞增殖用酶标仪做的,结果很好处理。但是流式细胞凋亡和周期一般用Flowjo软件分析。两个实验的结果是两组数据,分析方法也有一些不同,具体分析方法网上有教程。最终计算结果也不一样,比如凋亡计算的是凋亡率(早期凋亡+晚期凋亡);周期计算的是GS、G2等。
flowjo改细胞凋亡的颜色方法如下:对数轴和线性轴之间的转换。调整参数轴的范围。直方图中对纵轴调整布局编辑器(Layout)中对Y轴的调整。在布局编辑器(Layout)中对参数轴名称等属性的调整即可设置颜色。
这位同学,我下载了你的文件,用FlowJo分析了一下。首先,你的实验样本质量很差,无法看到明确的细胞群,即使是在对照组也一样。第二,染色很差,用PI染色无法看到细胞周期。第三,在采集数据的时候,没有设置单细胞gate。建议你重新做实验。尤其是染色的时候注意采用正确的步骤。
抗体选择与定制华盈生物提供定制化的30/33marker Panel,以及10个定制通道。定制抗体需确保与CyTOF兼容,并考虑到实验风险,尤其是抗体偶联过程的周期较长。数据分析与解读CyTOF结果以FCS格式呈现,包含每个细胞的蛋白表达信息。主流平台如Cytobank和Flowjo可进行分析,R语言也有丰富的分析包。
ISAC制定的流式数据的标准格式为FCS格式,Accuri C6的CFlow软件默认的数据保存格式为其特有的C6格式。因此,在用FlowJo分析Accuri C6数据之前,需要将数据转换为FCS格式。
细胞增值的检验方法:Brdu标记法细胞以5*105/ml细胞数接种于直径35ml培养皿中,培养一天,用含0.4%FCS培养液同步化三天,使绝大多数细胞处于Go期。终止细胞培养前,加入Brdu,37℃孵育40min。弃培养液,波片用PBS洗涤3次。甲醇/醋酸固定10min。
流式细胞仪可同时进行多参数测量,信息主要来自特异性荧光信号及非荧光散射信号。测量是在测量区进行的,所谓测量区就是照射激光束和喷出喷孔的液流束垂直相交点。液流中央的单个细胞通过测量区时,受到激光照射会向立体角为2π的整个空间散射光线,散射光的波长和入射光的波长相同。
原理:根据激发光的强弱,来判断细胞和染色物质的结合情况,从而得到要检测的结果。将待测细胞染色后,制成单细胞悬液。
流式细胞仪工作的原理是使悬浮在液体中分散的细胞或微粒一个个地依次通过样品池,细胞的流速可达9米/秒,同时由荧光探测器捕获荧光信号并转换成分别代表前向散射角、侧向散射角和不同荧光强度的电脉冲信号,经计算机处理形成相应的点图、直方图和假三维结构图像进行分析。
如上所述,流式细胞仪是由液流系统、光路系统以及检测分析系统三部分组成,部分仪器还具有分选功能,能对粒子进行充电和偏转从而实现细胞分选。
流式细胞仪通常以激光作为发光源。经过聚焦整形后的光束,垂直照射在样品流上,被荧光染色的细胞在激光束的照射下,产生散射光和激发荧光。这两种信号同时被前向光电二极管和90°方向的光电倍增管接收。
流式细胞仪的工作原理涉及参数测量、样品分选及数据处理等核心环节。首先,参数测量是基于激光照射和散射的原理。细胞在测量区中通过,其散射光强度和空间分布反映了细胞的大小、形态、质膜结构以及内部结构。
流式细胞只能比较细胞的相对大小和胞内的复杂程度,FSC对应的是细胞的相对大小,FSC的值越大表示细胞越大,SSC对应的是细胞内部复杂程度,SSC的值越大说明细胞内部的颗粒越多。
首先,使用Image J打开需要分析的图片;选择straight直线工具,对照标尺画一条直线。选择“analyse”→“measure”对上一步和标尺相同长度直线进行测量。根据标尺测量长度,设置试剂长度;“Analyse”→“set scale”。此处设置的图片标尺是50,单位μm. 设置完毕后,保存该设置。
一般FSC是用来看细胞大小的,而且在检测的时候是设为线性的。也就是说,FSC上的信号强弱是和细胞大小成正比的。前提是每次检测的时候机器的设置一样,并且gate out了碎片。
第一步是在FSC, SSC散点图上根据细胞大小gate出淋巴细胞群。然后在gate出单细胞群。检测CD4和CD8,应该还要同时染色CD 先选中CD3阳性的细胞(T细胞),然后把T细胞在CD4/CD8的散点图上再显示,可以分为四个象限。分别代表CD4阳性,CD8阳性,双阳性,和无染色的。
TBNK检测则是非常重要的量化评估免疫力关键,因为它用可以评估免疫功能的强弱,是能够精准监控淋巴细胞亚群,解析免疫系统的平衡状态,进而能够有效地的保护免疫力,为身体筑起第一道防线。并且这一检测技术在目前为止在免疫领域是很有应用前景的一个技术,因此我们说TBNK是量化评估免疫力的关键。
通过深入研究,TBNK检测为我们提供了一种科学的量化工具,让我们能更直观地理解并管理自身的免疫力。这不仅关乎个人的健康,也是我们对自身健康的主动掌握,更是预防疾病、维持健康生活的重要手段。记住,每一份对免疫系统的尊重,都可能在关键时刻拯救我们于疾病的魔爪之中。
1、列表法:是将实验所获得的数据用表格的形式进行排列的数据处理方法。列表法的作用有两种:一是记录实验数据,二是能显示出物理量间的对应关系。图示法:是用图象来表示物理规律的一种实验数据处理方法。一般来讲,一个物理规律可以用三种方式来表述:文字表述、解析函数关系表述、图象表示。
2、数据处理方法有:标准化:标准化是数据预处理的一种,目的的去除量纲或方差对分析结果的影响。作用:消除样本量纲的影响;消除样本方差的影响。主要用于数据预处理。汇总:汇总是一个经常用于减小数据集大小的任务。汇总是一个经常用于减小数据集大小的任务。
3、数据处理最基本的四种方法列表法、作图法、逐差法、最小二乘法。数据处理,是对数据的采集、存储、检索、加工、变换和传输。根据处理设备的结构方式、工作方式,以及数据的时间空间分布方式的不同,数据处理有不同的方式。不同的处理方式要求不同的硬件和软件支持。
4、数据分析与处理方法:采集 在大数据的采集过程中,其主要特点和挑战是并发数高,因为同时有可能会有成千上万的用户来进行访问和操作,比如火车票售票网站和淘宝,它们并发的访问量在峰值时达到上百万,所以需要在采集端部署大量数据库才能支撑。